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Title: Caracterización de genes de resistencia en micobacterias atípicas aisladas en el centro de investigación microbiológica (CIM) en el periodo 2014 - 2019
Authors: Arisqueta Herranz, Lino
Buele Chica, Dayci Colombia
Keywords: MICOBACTERIAS NO TUBERCULOSAS
RESISTENCIA A CLARITROMICINA
SECUENCIACIÓN
MALDI TOF
Issue Date: 28-Sep-2021
Publisher: Universidad Internacional SEK
Citation: CT- CBIO B928c/2021
Abstract: El género Mycobacterium incluye más de 150 especies, de las que solo unas poca (complejo M. tuberculosis, M. leprae) se consideran como patógenos primarios, siendo el resto de las especies consideradas como microorganismos ambientales que solo en determinadas circunstancias dan lugar a patología humana. En las últimas décadas la incidencia de las infecciones de piel y tejido blando, así como las enfermedades pulmonares producidas por el complejo M. abscessus, la MNT más relevante en patología humana, se ha incrementado significativamente en todo el mundo. En Ecuador, se han registrado infecciones de piel y tejidos blandos asociadas con procedimientos cosméticos causadas por este microorganismo. El régimen de antibióticos recomendado para el tratamiento de la infección por M. abscessus (directrices ATS / IDSA 2007) es una terapia basada en varios macrólidos y, por tanto, la Claritromicina se considera un antibiótico clave. Sin embargo, M. abscessus ha demostrado ser resistente a múltiples antibióticos incluyendo la claritromicina. La resistencia adquirida a Claritromicina se asocia con mutaciones puntuales en las posiciones 2058 y 2059 del gen rrl que codifica el rRNA 23S, siendo la primera la que causa una mayor elevación de MIC. La resistencia inducible es conferida por el gen erm(41), que codifica las metilasas ribosomales de la eritromicina, y las mutaciones en el mismo provocan la pérdida de resistencia inducible. En vista de la creciente incidencia de las infecciones por M. abscessus y los problemas con su tratamiento por culpa de la resistencia antibiótica, este trabajo se planteó el análisis de los mecanismos de resistencia a claritromicina de cepas previamente indentificadas como MNT y criopreservadas en el Centro de Investigación Microbiológica, Guayaquil. Para ello se empleó RT – PCR con sondas específicas para detectar variantes mutantes de los genes de resistencia mencionados más arriba. Además, se comparó un método de identificación por RT – PCR con el bien establecido método de diagnóstico por MALDI – TOF para micobacterias. Nuestros resultados indican que la identificación basada en RT – PCR es una alternativa a las pruebas fenotípicas al uso para M. abscessus. También mostró que las RT - PCR para la detección de mecanismos de resistencia a claritromicina, aunque con limitaciones, son una buena alternativa a las pruebas de sensibilidad.
Description: The genus Mycobacterium includes more than 150 species, of which only a few (M. tuberculosis complex, M. leprae) are considered as primary pathogens, with the rest of the species considered as environmental microorganisms that only under certain circumstances give rise to pathology human. In recent decades, the incidence of skin and soft tissue infections, as well as lung diseases caused by the M. abscessus complex, the most relevant NTM in human pathology, has increased significantly throughout the world. In Ecuador, skin and soft tissue infections associated with cosmetic procedures caused by this microorganism have been recorded. The recommended antibiotic regimen for the treatment of M. abscessus infection (ATS / IDSA 2007 guidelines) is a multi-macrolide-based therapy and therefore Clarithromycin is considered a key antibiotic. However, M. abscessus has been shown to be resistant to multiple antibiotics, including clarithromycin. Acquired resistance to Clarithromycin is associated with point mutations at positions 2058 and 2059 of the rrl gene encoding 23S rRNA, the former causing a greater elevation of MIC. Inducible resistance is conferred by the erm gene (41), which encodes the ribosomal methylases of erythromycin, and mutations in it cause the loss of inducible resistance. In view of the growing incidence of M. abscessus infections and the problems with its treatment due to antibiotic resistance, this work aimed to analyze the mechanisms of resistance to clarithromycin of strains previously identified as NTM and cryopreserved in the Center. of Microbiological Research, Guayaquil. For this, RT-PCR with specific probes was used to detect mutant variants of the resistance genes mentioned above. Furthermore, an RT-PCR identification method was compared with the well established MALDI-TOF diagnostic method for mycobacteria. Our results indicate that identification based on RT-PCR is an alternative to the phenotypic tests used for M. abscessus. It also showed that RT-PCR for the detection of mechanisms of resistance to clarithromycin, although with limitations, is a good alternative to sensitivity tests.
URI: https://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/4471
Appears in Collections:Maestría en Biomedicina

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