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https://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/5777| Title: | Filogenia y epidemiología molecular de genes de resistencia blaKPC, blaNDM-1, blaOXA-48 |
| Authors: | Navarro, Juan Carlos Maldonado Barros, Mateo Shai |
| Keywords: | BIOMEDICINA BACTERIAS MULTIRRESISTENTES CARBAPENEMASAS ANÁLISIS FILOGENÉTICO KLEBSIELLA PNEUMONIAE |
| Issue Date: | 2025 |
| Publisher: | Universidad Internacional SEK |
| Citation: | UISEK-T MBME M244f/2025 |
| Abstract: | A single paragraph of about 300 words maximum. For research articles, abstracts should give a pertinent overview of the work. We strongly encourage authors to use the following style of structured abstracts, but without headings: (1) Background: Place the question addressed in a broad context and highlight the purpose of the study; (2) Methods: briefly describe the main methods or treatments applied; (3) Results: summarize the article’s main findings; (4) Conclusions: indicate the main conclusions or interpretations. The abstract should be an objective representation of the article and it must not contain results that are not presented and substantiated in the main text and should not exaggerate the main conclusions. |
| Description: | El uso indiscriminado de antibióticos ha provocado el aparecimiento de las bacterias multirresistentes. Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, son bacterias del grupo ESKAPE debido a que produce enzimas que destruyen a los antimicrobianos e inactivan su efecto terapéutico, por lo que se denominan como carbapenemasas, blaKPC, blaNDM y blaOXA48, de los cuales son considerados como genes productores de carbapenemasas (PDC). La falta de estudios en el Ecuador y los sitios en donde se ha evidenciado la presencia de estos genes pone en riesgo a la población ecuatoriana. La hipótesis planteada es si la diversidad filogenética de los genes PDC muestran una diferenciación entre el Ecuador y los países vecinos, y si existe un patrón filogeográfico de los genes PDC mostrando clados regionales en Latinoamérica y otras regiones del mundo. El método se realizó mediante un muestreo in silico de secuencias disponibles en NCBI que contengan genes PDC de Klebsiella pneumoniae, de muestras de Ecuador, países vecinos de la región y secuencias de otras regiones geográficas. Se construyeron cuatro matrices de secuencias, y se alinearon mediante el software MUSCLE con penalidades altas para lograr una homología posicional. Posteriormente se construyeron hipótesis filogenéticas bajo los criterios de máxima parsimonia (MP) en PAUP v.4.0 y por máxima verosimilitud, con apoyo estadístico de ramas por bootstrap con 500 pseudoréplicas, en MEGAX. El análisis filogenético de los genes PDC mostró altos valores de bootstrap, pero con baja estructuración filogeográfica y frecuentes politomías. Las secuencias de Ecuador se agruparon con secuencias de Turquía, Irán y Túnez, lo que evidencia transmisión horizontal mediada por plásmidos y evolución convergente. El estudio enfatiza la necesidad de fortalecer las investigaciones de metagenómica y filogenia comparativa, además de estrategias de control para limitar infecciones nosocomiales. |
| URI: | https://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/5777 |
| Appears in Collections: | Maestría en Biomedicina |
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