Análisis bioinformático de Candida albicans de origen vulvovaginal resistente a fluconazol

Abstract

Candida albicans es un hongo clasificado como de prioridad crítica por la Organización Mundial de la Salud debido a su capacidad de causar diversas enfermedades, entre ellas la candidiasis vulvovaginal CVV. El uso indiscriminado de antimicóticos se ha relacionado con la resistencia a los azoles y la enfermedad vaginal recurrente. Esta situación representa un problema de salud pública debido a que la resistencia al fluconazol dificulta el tratamiento de la candidiasis vulvovaginal, con sintomatología que perdura en el tiempo. Sin embargo, existe información limitada sobre la resistencia a los antifúngicos comerciales de los aislamientos vulvovaginales. Este estudio tiene como objetivo identificar la presencia de genes de resistencia a fluconazol en un aislamiento vulvovaginal de Candida albicans mediante PCR, NGS y análisis bioinformático, para determinar la relación filogenética con aislamientos de otros países y comprender el posible origen de la cepa. Para la identificación molecular, se extrajo su ADN y se amplificó por PCR, lo que permitió la identificación de genes específicos como: ITS y ERG3. Por otro lado, para la secuenciación del genoma completo por Illumina, luego de lo cual se realizó un ensamblaje del genoma utilizando la plataforma Galaxy Australia. Para el análisis filogenético, el aislado de interés se alineó con otros aislados similares de otros países utilizando el software MEGAX, basado en un análisis de máxima verosimilitud, donde se ubicó nuestro aislado ecuatoriano y se relacionó con grupos de América del Norte y Asia. El análisis filogenético sugiere una relación evolutiva entre los aislados de Candida albicans de Tanzania, Irán, México y Japón. Además, la diversidad genética observada dentro de C. albicans sugiere la presencia de múltiples linajes con dispersión global. Usando la secuencia, identificamos la presencia de múltiples genes de resistencia a fluconazol. En conjunto, este trabajo brinda una nueva visión de los genes que juegan un papel importante en la aparición de resistencia a antifúngicos. Estos hallazgos no solo tienen implicaciones clínicas para CVV, sino que también abren el camino a nuevos estudios para tratamientos más efectivos.