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http://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/5387
Title: | Diseño in silico de una vacuna multiepítopo dirigida contra las proteínas de superficie del monkeypox virus. |
Authors: | Herrera Yela, Andrés Rivera Orellana, Jhoan Sebastián |
Keywords: | BIOTECNOLOGÍA MPXV Vacunología inversa In silico HTL (Linfocitos T helper), |
Issue Date: | Aug-2024 |
Publisher: | Universidad Internacional Sek |
Citation: | CT-CBIO R621m/2024 |
Abstract: | El virus del Monkeypox (MPXV) es un patógeno zoonótico estrechamente relacionado con el virus de la viruela, que puede causar brotes epidémicos graves en humanos con una mortalidad significativa. Dada su capacidad para propagarse rápidamente y su potencial de generar brotes epidémicos, el desarrollo de estrategias efectivas de vacunación es crucial. Este estudio representa un avance innovador en el diseño de vacunas, utilizando herramientas bioinformáticas avanzadas para identificar epítopos específicos que pueden activar de manera eficaz las células T helper (HTL) a través de complejos MHC-II. En este estudio, se llevó a cabo la identificación de epítopos del virus del Monkeypox capaces de activar células T helper (HTL) a través del MHC-II. Se comenzó analizando 50,040 secuencias virales, de las cuales se filtraron y seleccionaron los epítopos más óptimos, reduciéndolos a 13 epítopos finales con mayor afinidad para las moléculas MHC-II. Estos epítopos seleccionados se integraron en una vacuna multiepítopo, añadiendo secuencias espaciadoras y adyuvantes para mejorar la respuesta inmunitaria. Luego, se realizó el modelado 3D de la vacuna para predecir la estructura y evaluar su estabilidad. Las simulaciones de dinámica molecular ayudaron a refinar el modelo y asegurar su estabilidad estructural. Los resultados indicaron que los epítopos seleccionados tienen alta afinidad por las moléculas MHC-II, y el modelado 3D de la vacuna mostró que la estructura diseñada es estable. Las simulaciones sugieren que la vacuna multi-epítopo es capaz de inducir respuestas inmunitarias robustas, destacando su potencial como una estrategia efectiva para la inmunización contra el virus del Monkeypox. La vacuna resultante no solo ha demostrado inducir respuestas inmunitarias robustas y de memoria en modelos computacionales, sino que también ha sido validada mediante modelado 3D, destacando por su estructura molecular estable y la óptima exposición de los epítopos. Además, el análisis detallado de cobertura poblacional subraya su potencial para ofrecer una protección global significativa, convirtiéndola en una herramienta esencial para combatir epidemias de Monkeypox y promoviendo la salud pública a escala mundial. |
Description: | The monkeypox virus (MPXV) is a zoonotic pathogen closely related to the smallpox virus, capable of causing severe epidemic outbreaks in humans with significant mortality. Given its ability to spread rapidly and its potential to generate epidemic outbreaks, the development of effective vaccination strategies is crucial. This study represents an innovative advancement in vaccine design, utilizing advanced bioinformatics tools to identify specific epitopes that can effectively activate helper T cells (HTL) through MHC-II complexes. In this study, epitopes of the monkeypox virus capable of activating helper T cells (HTL) through MHC-II were identified. The process began with the analysis of 50,040 viral sequences, from which the most optimal epitopes were filtered and selected, narrowing them down to 13 final epitopes with the highest affinity for MHC-II molecules. These selected epitopes were integrated into a multi-epitope vaccine, adding spacer sequences and adjuvants to enhance the immune response. Subsequently, 3D modeling of the vaccine was performed to predict its structure and assess itsstability. Molecular dynamics simulations helped refine the model and ensure itsstructuralstability. The resultsindicated that the selected epitopes have high affinity for MHC-II molecules, and the 3D modeling of the vaccine showed that the designed structure is stable. The simulations suggest that the multi-epitope vaccine is capable of inducing robust immune responses, highlighting its potential as an effective strategy for immunization against the monkeypox virus. The resulting vaccine has not only demonstrated the ability to induce robust and memory immune responses in computational models but has also been validated through 3D modeling, standing out for its stable molecular structure and optimal epitope exposure. Additionally, the detailed population coverage analysis underscores its potential to offer significant global protection, making it an essential tool to combat monkeypox epidemics and promote public health on a global scale. |
URI: | http://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/5387 |
Appears in Collections: | Biotecnología |
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