Análisis bioinformático de los patrones de expresión génica asociados al efecto de los fármacos trastuzumab, pertuzumab y T-DM1 en clones resistentes de cáncer de mama HER2+

Abstract

La resistencia a las terapias dirigidas constituye uno de los retos actuales en el tratamiento del subtipo de cáncer de mama HER2+. En este contexto, con el fin de superar la resistencia a los tratamientos que emplean anticuerpos monoclonales (mAbs), se han desarrollado conjugados anticuerpo-fármaco (ADCs), como el Trastuzumab-emtansina (T-DM1). Sin embargo, se ha reportado la capacidad de las células cancerosas de adquirir resistencia a estos fármacos. En este sentido, es necesario dilucidar los mecanismos moleculares que promueven la aparición de resistencia a este tipo de fármacos. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue identificar los patrones de expresión génica asociados al efecto de los fármacos Trastuzumab (T), la combinación Trastuzumab + Pertuzumab (TP) y T-DM1 en clones resistentes de cáncer de mama HER2+, mediante un análisis transcriptómico in sílico, para establecer potenciales dianas terapéuticas. Se analizaron los datos de GSE121105 y GSE100192 presentes en la base de datos GEO del NCBI; los genes diferencialmente expresados (DEGs) fueron analizados utilizando herramientas como edgeR y limma en RStudio. Posteriormente, se enriquecieron los DEGs en la ontología génica (GO), incluidas las funciones moleculares (MF), los componentes celulares (CC), y los procesos biológicos (BP) y se realizó un análisis de enriquecimiento de vías con GSEA. En este estudio, se identificaron 14 genes en común relacionados con el efecto del Trastuzumab en clones resistentes, 27 genes comunes en clones resistentes a TP y 614 genes comunes para clones resistentes a T-DM1. Los genes IGFBP3 (subexpresado en la resistencia a Trastuzumab), CKS2 (sobreexpresado en la resistencia a TP) y HMGCS2 (subexpresado en la resistencia a T-DM1 y sobreexpresado en resistencia a Trastuzumab y en la resistencia TP) mostraron diferencias relevantes en sus patrones de expresión génica y podrían ser considerados potenciales dianas terapéuticas que contribuyan a superar las resistencias a los mAbs y al conjugado T-DM1 en el cáncer de mama HER2+.