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Title: Caracterización de la microbiota vaginal en pacientes VPH positivo mediante el análisis bioinformático de secuencias 16s ARN y su influencia en el riesgo, protección y persistencia del contagio por VPH
Authors: Espinosa Espinosa, Jorge
Tello Gallegos, Ricardo Paúl
Keywords: BIOMEDICINA
MICROBIOTA
VPH
SECUENCIACIÓN
METAGENÓMICA
Issue Date: Apr-2024
Publisher: Universidad Internacional Sek
Citation: CT-CBIO T277c/2024
Abstract: La infección causada por el virus del papiloma humano (VPH) es una de las enfermedades de transmisión sexual más frecuentes, pertenece al grupo de virus oncogénicos potencialmente cancerígeno. La microbiota se desarrolla como un determinante que podría influir en el equilibrio aumentando o disminuyendo la evolución y capacidad de promoción de infecciones virales. La homeostasis microbiana del aparato reproductor femenino mantiene el equilibrio de las comunidades bacterianas que funcionan como barrera de protección frente a infecciones causadas por microorganismos patógenos. Los cambios en la microbiota altera el microambiente cérvico – vaginal permitiendo la persistencia, proliferación y desarrollo de cáncer frente a la infección por VPH. Sin embargo, la composición microbiana confluente de diferentes regiones geográficas y su asociación con diferentes tipos de la infección por VPH no se han reportado. El presente estudio pretende identificar la microbiota cérvico – vaginal mediante el análisis metagenómico de secuencias 16s ARN de diferentes fuentes geográficas y su relación con los tipos de infección por VPH. Se identificaron perfiles microbianos confluentes: Lactobacillus spp., Prevotella spp., y Gardnerella spp. están presentes independientemente del tipo de infección y la fuente geográfica. Se observó mayor diversidad en pacientes negativas para VPH, con un ecosistema más equilibrado y resistente a perturbaciones. Identificamos biomarcadores asociados a los diferentes tipos de infección por VPH, incluyendo Corynebacterium jeikeium y Corynebacterium urealyticum en infecciones simples. Por otro lado, Eubacterium limosum es un potencial biomarcador relevante en la modulación inmunológica ante las infecciones por VPH. Se identificaron marcadores para infecciones múltiples de VPH y los posibles indicadores biológicos de cepas de bajo y alto riesgo de cáncer cervical. La presente investigación demostró la asociación de la ecología microbiana cérvico – vaginal, los tipos de infección por VPH y la búsqueda de biomarcadores como potenciales mecanismos de identificación temprana. Sin embargo, futuras investigaciones requieren la integración de factores socio – demográficos y las limitaciones del análisis metagenómico para una mejor precisión e interpretación de los resultados.
Description: Infection caused by the human papillomavirus (HPV) is one of the most frequent sexually transmitted diseases and belongs to the group of potentially carcinogenic oncogenic viruses. The microbiota develops as a determinant that could influence the balance by increasing or decreasing the evolution and promotion capacity of viral infections. The microbial homeostasis of the female reproductive tract maintains the balance of bacterial communities that function as a protective barrier against infections caused by pathogenic microorganisms. Changes in the microbiota alter the cervical-vaginal microenvironment allowing the persistence, proliferation and development of cancer in the face of HPV infection. However, the confluent microbial composition of different geographic regions and its association with different types of HPV infection have not been reported. The present study aims to identify the cervical – vaginal microbiota by metagenomic analysis of 16s RNA sequences from different geographical sources and their relationship with HPV infection types. Confluent microbial profiles were identified: Lactobacillus spp, Prevotella spp, and Gardnerella spp were present regardless of infection type and geographic source. Greater diversity was observed in HPV-negative patients, with a more balanced ecosystem resistant to perturbations. We identified biomarkers associated with different types of HPV infection, including Corynebacterium jeikeium and Corynebacterium urealyticum in single infections. On the other hand, Eubacterium limosum is a potential biomarker relevant to immune modulation in HPV infections. Markers for multiple HPV infections and potential biomarkers of low and high-risk strains for cervical cancer were identified. The present investigation demonstrated the association of cervical microbial ecology, HPV infection types and biomarker search as potential early identification mechanisms. However, future research requires the integration of socio-demographic factors and the limitations of metagenomic analysis for better accuracy and interpretation of the results.
URI: http://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/5259
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