Identificación de posibles epítopos inmunoterapéuticos en genotipos de HPV con mayor prevalencia en Ecuador. Un análisis in silico.

Abstract

El virus del papiloma humano (HPV), es el principal agente etiológico del cáncer de cuello uterino. Una infección no tratada a tiempo, prolongada durante años y que ha desarrollado lesiones precancerosas, producto de los oncogenes de los genotipos de alto riesgo, conduce al desarrollo de cáncer de cuello uterino. Datos de la OMS indican que los genotipos 16 y 18 son los responsables de causar más del 70% de las infecciones por HPV a nivel mundial, en tanto, Ecuador reportan los genotipos 16,18,31,33,58 y 66, como los más prevalentes durante el año 2008 al presente estudio, además, se disponen de las secuencias de la región L1 reportadas en diferentes unidades de salud, para la predicción de epítopos de células T. Para el análisis bioinformático entre el péptido, el MHC I y II y células B, se emplearon los alelos disponibles en la base de datos del NCBI para seres humanos. El análisis filogenético de las secuencias reportadas propone reclasificar a 11 y 15 diferentes genotipos HPV 9 como genotipos HPV 58 y HPV 16 respectivamente. El estudio realizado detalla por primera vez, el análisis de posibles epítopos inmunoterapéuticos basados en la proteína L1 de la región tardía de los genotipos 16,18, 31, 33 y 58 reportados en unidades de salud del Ecuador, el análisis de la inmunogenicidad mostro que el score más alto reportado corresponde a los alelos MHC-I, HLA-B*44:03, MHC-II, HLA-DRB1*07:01 y diversos péptidos capaces de generar una respuesta adecuada frente a las células B. La visualización 3D de las proteínas generadas, marca los péptidos de la proteína L1 con alto nivel de inmunogenicidad frente a las células T y B.