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Title: Filogenética molecular para la identificación de Leishmania spp, mediante el análisis de secuencias de Citocromo b (Cytb) del ADN mitocondrial.
Authors: Navarro Castro, Juan Carlos
Hernández Aguirre, Luis Santiago
Keywords: BIOMEDICINA
LEISHMANIASIS
KINETOPLASTIDOS
TAXONOMÍA
FILOGENÉTICA
Issue Date: Sep-2023
Publisher: Universidad Internacional Sek
Citation: CT-CBIO H557f/2023
Abstract: La leishmaniasis es un conjunto de infecciones parasitarias con amplia diversidad epidemiológica e importante relevancia clínica siendo endémica en varios países. Se ubica entre las enfermedades tropicales desatendidas más importantes y es considerada como un grave problema de salud pública por la Organización Mundial de la Salud, debido a la alta morbilidad y mortalidad que la caracterizan. La enfermedad es ocasionada por parásitos del género Leishmania, describiéndose alrededor de 20 especies patógenas para el hombre que han demostrado una alta prevalencia en muchos países de América Latina entre ellos el Ecuador, habiéndose reportado casos en todo su territorio, sin embargo se requieren mayores estudios que profundicen en aspectos ecoepidemiológicos, epidemiología molecular y relaciones filogenéticas de las especies que permitan la aplicación y desarrollo de estrategias de intervención y control. El entendimiento de las relaciones evolutivas entre estas especies y el medio donde evolucionan es esencial para la predicción de patrones de transmisión y la epidemiología de la leishmaniasis. Nuestra hipótesis plantea que existe una marcada estructura filogenética de las especies de Leishmania presentes en Ecuador con base en el análisis del Citocromo b lo cual refleja un patrón de distribución relacionado con la región andina y amazónica del continente. Se aplicó el método de optimización de parsimonia máxima (MP) mediante el programa MEGA-11 para el análisis filogenético de las secuencias del gen Citocromo b mitocondrial (cytb) de Leishmania obtenidas de GeneBank. La matriz obtenida demostró efectividad para identificar las secuencias de Leishmania analizadas con base a las características filogenéticas a nivel de especies y subespecies. El análisis filogenético evidenció que la clasificación y distribución de las especies de Leishmania que circulan en el Ecuador concuerda con lo informado en investigaciones previas presentando un patrón de distribución geográfica relacionado con la costa del Pacífico, la región andina y amazónica del continente.
Description: Leishmaniasis is a group of parasitic infections with wide epidemiological diversity and important clinical relevance, being endemic in several countries. It is among the most important neglected tropical diseases and is considered a serious public health problem by the World Health Organization, due to the high morbidity and mortality that characterize it. The disease is caused by parasites of the genus Leishmania, describing about 20 species pathogenic to humans that have shown a high prevalence in many Latin American countries including Ecuador, having reported cases throughout its territory, however, further studies are required to deepen ecoepidemiological aspects, molecular epidemiology and phylogenetic relationships of the species that allow the application and development of intervention and control strategies. Understanding the evolutionary relationships between these species and the environment where they evolve is essential for the prediction of transmission patterns and the epidemiology of leishmaniasis. Our hypothesis is that there is a marked phylogenetic structure of Leishmania species present in Ecuador based on the analysis of Cytochrome b, which reflects a distribution pattern related to the Andean and Amazonian region of the continent. The maximum parsimony (MP) optimization method was applied using the MEGA-11 program for the phylogenetic analysis of Leishmania mitochondrial cytochrome b (cytb) gene sequences obtained from GeneBank. The matrix obtained showed effectiveness in identifying the Leishmania sequences analyzed based on phylogenetic characteristics at the species and subspecies level. The phylogenetic analysis showed that the classification and distribution of Leishmania species circulating in Ecuador is consistent with previous research, presenting a geographic distribution pattern related to the Pacific coast, the Andean and Amazonian regions of the continent.
URI: http://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/5143
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