Secuenciación de 3era generación de un plásmido portador de KPC-2 aislado de la cepa Salmonella enterica serovar Infantis

Abstract

Los antibióticos son una herramienta poderosa para combatir las infecciones. Sin embargo, su uso descontrolado ha favorecido la aparición de cepas bacterianas que presentan resistencia a múltiples fármacos, lo que imposibilita cada vez más el tratamiento de infecciones. Un ejemplo de esto es la bacteria Salmonella entérica serovar Infantis, encargada de producir la Salmonelosis. Este microorganismo se ha convertido en un patógeno importante para los sistemas de vigilancia a nivel mundial, debido a su capacidad de ser portador y diseminador de genes de resistencia frente a varios antibióticos ampliamente usados en infecciones humanas y animales. En Ecuador, en el 2018 se reportaron dos casos de salmonelosis producida por Salmonella entérica serovar Infantis productora de carbapenemasas. Estudios realizados por el INSPI demostraron que la bacteria presenta un fenotipo de multirresistencia que incluyen cefalosporinas, carbapenémicos y otros antibióticos de primera línea usados para el tratamiento de infecciones por parte de bacterias gram-negativas. Además, mediante un análisis de secuenciación de genoma se sabe que esta bacteria posee genes de resistencia como CTX-M-65 y blaKPC-2 y presenta plásmidos IncFIB(pN55391), IncM1 y IncX4 que están implicados en los mecanismos de resistencia bacteriana. Sin embargo, no se ha establecido la estructura de los plásmidos y la ubicación de los genes. Este estudio tendrá como finalidad la obtención de las secuencias completas de los plásmidos IncFIB(pN55391), IncM1, IncX4. De esta manera se confirmará de manera inequívoca la presencia de los genes de resistencia a carbapenémicos blaKPC-2 y CTX-M-65 dentro de uno o varios de estos plásmidos. Para el desarrollo de esta investigación se usará una cepa de Salmonella enterica serovar Infantis productora de KPC, donada por el INSPI y la plataforma de secuenciación de tercera generación MinION de Oxford Nanopore Technologies (ONT). La secuencia completa de los plásmidos será subida a bases de datos (NCBI) para ser compartida a nivel mundial. Esto permitirá realizar seguimientos epidemiológicos moleculares, la implementación de programas de vigilancia epidemiológica, establecer nuevos tratamientos para el tratamiento de este microorganismo, así como desarrollar nuevos métodos de diagnóstico.