Diversidad de la microbiota de flebótomos obtenidos en San Miguel de los Bancos, Pedro Vicente Maldonado, Mashpi y Puerto Quito, Pichincha – Ecuador, mediante secuenciación de 3era generación

Abstract

El flebótomo, es conocido como vector de enfermedades como Leishmaniasis y Bartonelosis. En el 2019, a nivel global se registraron más de 800 000 casos de enfermedades transmitidas por este insecto. Estudios indican que la composición bacteriana de la microbiota de vectores puede potenciar su capacidad vectorial. Sin embargo, no existe evidencia de estudios en la microbiota de flebótomos en la región de Pichincha, Ecuador. El objetivo del presente estudio fue determinar el perfil metagenómico basado en 16S bacteriano de los flebótomos Lutzomyia trapidoi y L. hartmanni obtenidos en el bosque andino del noroccidente de Pichincha – Ecuador, mediante secuenciación masiva de tercera generación con la finalidad de identificar el perfil bacteriano de estos vectores de acuerdo con el sitio al que pertenecen y analizar si representan un riesgo para la salud de las comunidades humanas que habitan en estas zonas. Se realizó la extracción de ADN de 150 flebótomos previamente recolectados en San Miguel de los Bancos, Pedro Vicente Maldonado, Mashpi y Puerto Quito, por el CIZ. Se procedió a la amplificación de 16S con adaptadores OXO y posteriormente se realizó la agrupación de acuerdo con las variables de especie, sexo y sitio de recolección. Se procedió a secuenciar utilizando el MinION y el análisis de datos se realizó mediante la plataforma EPI2ME. Se encontraron bacterias pertenecientes al filo Bacillota y cercanas al género Bacillus, así como, bacterias pertenecientes a los géneros Enterobacteriaceae, Pseudomonadaceae. Las bacterias gram negativas predominan en la microbiota del flebótomo por lo que se puede deducir que estas desempeñan roles fundamentales en el metabolismo y desarrollo del sistema inmune de este insecto. Es posible que variables como la temperatura y altura influyan en la variabilidad de bacterias ambientales en las distintas localidades de estudio. Hay evidencia de bacterias patógenas para el ser humano que podrían estar ligadas al potencial vectorial del flebótomo.