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http://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/5005| Title: | Primer reporte de fungemia por Fusarium oxysporum en un caso fatal de paciente por COVID-19 en Ecuador, mediante identificación filogenética molecular |
| Authors: | Navarro Castro, Juan Carlos Jimbo Zapata, Franco Alexander |
| Keywords: | BIOMEDICINA FUNGEMIA SARS-COV-2 IDENTIFICACIÓN MOLECULAR FILOGENÉTICA |
| Issue Date: | Mar-2023 |
| Publisher: | Universidad Internacional Sek |
| Citation: | CT-CBIO J614p/2023 |
| Abstract: | La mayoría de fusariosis invasivas en humanos son causadas por los complejos de especies Fusarium solani (FSSC) y Fusarium oxysporum (FOSC). El primer complejo es más resistente a la terapia de elección que el segundo, por lo que la identificación rápida y precisa de género y especie es importante debido al contexto clínico del microorganismo. La OMS categorizó a este patógeno dentro del grupo de alta prioridad, debido a limitadas opciones terapéuticas y a su multirresistencia antifúngica. Las técnicas convencionales solo permiten identificar el género; el uso de técnicas moleculares permite una correcta identificación a nivel de género y especie. Describimos el primer reporte de caso en Ecuador de fungemia asociado a SARS-CoV-2 en un paciente varón de 70 años con COVID-19, hipertensión arterial crónica controlada y sin otras comorbilidades. Durante la estancia hospitalaria, el paciente desarrolló fungemia por Fusarium oxysporum, la cual terminó en su deceso. Se realizó la identificación del género con técnicas convencionales y la especie con técnicas moleculares y filogenéticas, mediante secuenciación del espaciador intergénico ribosomal ITS. En Ecuador, no existen registros de secuencias de Fusarium spp aisladas de muestras clínicas, contando solo con aislados ambientales. No se conoce la incidencia de la fungemia en nuestro medio, debido a la falta de reportes o estudios epidemiológicos. El virus SARS-CoV-2 causa daño al epitelio respiratorio, produce una desregulación inmunológica, por lo cual los pacientes son más susceptibles a desarrollar infecciones fúngicas; únicamente las candidiasis y aspergilosis han sido documentadas ampliamente en pacientes críticos con COVID-19, mientras que otras que otras infecciones fúngicas invasivas han sido menos reportadas. Las técnicas moleculares son un apoyo para la identificación y diagnóstico específico de enfermedades micóticas poco frecuentes que tienen altas tasas de mortalidad y constituyen una herramienta potente de identificación inequívoca, para una estrategia de tratamiento y, para el seguimiento epidemiológico de casos. |
| Description: | : Most invasive Fusarium wilts in humans are caused by the Fusarium solani (FSSC) and Fusarium oxysporum (FOSC) species complexes. The first complex is more resistant to the therapy of choice than the second, so rapid and accurate identification of genus and species is important due to the clinical context of the microorganism. The WHO categorized this pathogen within the high priority group, due to limited therapeutic options and its antifungal multiresistance. Conventional techniques only allow gender identification; the use of molecular techniques allows a correct identification at the genus and species level. We describe the first case report in Ecuador of fungemia associated with SARS-CoV-2 in a 70-year-old male patient with COVID-19, controlled chronic arterial hypertension and no other comorbidities. During the hospital stay, the patient developed fungemia due to Fusarium oxysporum, which ended in his death. The identification of the genus was carried out with conventional techniques and the species with molecular and phylogenetic techniques, through sequencing of the ribosomal intergenic spacer ITS. In Ecuador, there are no records of Fusarium spp sequences isolated from clinical samples, with only environmental isolates. The incidence of fungemia in our environment is unknown, due to the lack of reports or epidemiological studies. The SARS-CoV-2 virus causes damage to the respiratory epithelium, produces immune dysregulation, which makes patients more susceptible to developing fungal infections; Only candidiasis and aspergillosis have been widely documented in critically ill patients with COVID-19, while other than other invasive fungal infections have been less reported. Molecular techniques are a support for the identification and specific diagnosis of rare fungal diseases that have high mortality rates and constitute a powerful tool for unequivocal identification, for a treatment strategy and for the epidemiological follow-up of cases. |
| URI: | http://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/5005 |
| Appears in Collections: | Maestría en Biomedicina |
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