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Title: Determinantes moleculares de resistencia a antibióticos presentes en bacterias aisladas en muestras biológicas procedentes del hospital IESS de Ambato
Authors: Ramírez Iglesias, José Rubén
Duque Pazmiño, Ana Belén
Keywords: BIOMEDICINA
RESISTENCIA ANTIBIÓTICA
NANOPOROS
DETERMINANTES MOLECULARES
PROBLEMA DE SALUD
Issue Date: Aug-2022
Publisher: Universidad Internacional Sek
Citation: CT-CBIO D946d/2022
Abstract: Antecedentes: La resistencia antibiótica es tan antigua como la creación de los antibióticos, su expansión a nivel mundial tiene como causas principales la globalización y el uso de antibióticos en al ámbito agrícola y ganadero. Este problema se ha convertido en un problema de salud muy grave a nivel mundial ya que para el año 2050 aproximadamente, se estima que la mortalidad aumentará al doble a comparación con la cifra actual. Hoy en día no existe una normativa que estipule lineamientos para el manejo y control de los antibióticos, por lo que tenemos antibióticos que son de venta libre y de uso indiscriminado por la población en general, aumentando la morbi-mortalidad y los costos en salud para el estado, convirtiéndose en un importante problema de salud. Materiales y Métodos: Se recolectarán 90 muestras de secreciones traqueales, orina y hemocultivos (30 de cada una), correspondientes a cada bacteria de nuestro interés (E.coli, P. aeruginosa, K. pneumoniae) de pacientes que se encuentren hospitalizados en el área de terapia intensiva del Hospital IESS de Ambato y sin antecedente de recibir en dicha hospitalización antibioticoterapia. Se realizará extracción de ADN usando el kit de extracción de ADN comercial de QIAGEN, posteriormente se realizará secuenciación de ADN con nanopore (kit SQK rbk-004) agrupándolos de acuerdo con cada bacteria y origen de la muestra según los códigos de barra. Se utilizara las bases de datos WIMP, AMR y CARD, estas herramientas nos ayudaran al análisis de secuencias moleculares que incluyen DLAST y Gene Identifier mediante las cuales se puede predecir resistomas. Resultados: Se espera encontrar con mayor frecuencia la presencia de K. pneumoniae, ya que es la más reportada en cultivos de secreciones traqueales con lo cual se optimizará el uso de antibióticos disminuyendo la morbi mortalidad en los establecimientos de salud además se reducirán los recursos de salud para el país.
Description: Background: Antibiotic resistance is as old as the creation of antibiotics, its expansion worldwide has globalization and the use of antibiotics in agriculture and livestock as its main causes. This problem has become a very serious health problem worldwide since by the year 2050 approximately, it is estimated that mortality will double compare to the current figure. Today there is no regulation that stipulates guidelines for the management and control of antibiotics, so we have antibiotics that are freely sold and used indiscriminately by the general population, increasing morbidity and mortality and health costs for the state, becoming a major health problem. Materials and Methods: 90 samples of tracheal secretions, urine and blood cultures (30 of each), corresponding to each bacterium of our interest (E. coli, P. aeruginosa, K. pneumoniae) will be collected from patients who are hospitalized in the intensive care area of the IESS Hospital in Ambato and with no history of receiving antibiotic therapy in said hospitalization. DNA extraction will be performed using QIAGEN's commercial DNA extraction kit, then DNA sequencing will be performed with nanopore (SQK rbk-004 kit) grouping them according to each bacterium and origin of the sample according to the barcodes. The WIMP, AMR and CARD databases will be used, these tools will help us analyze molecular sequences that include DLAST and Gene Identifier through which resistomes can be predicted. Results: It is expected to find the presence of K. pneumoniae more frequently, since it is the most reported in cultures of tracheal secretions, which will optimize the use of antibiotics, reducing morbidity and mortality in health establishments, as well as reducing the resources of health for the country.
URI: http://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/4835
Appears in Collections:Maestría en Biomedicina

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