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Title: Taxonomía filogenética y molecular de Trypanosoma spp con marcadores de ADN 18S ITS y Catepsina L
Authors: Navarro Castro, Juan Carlos
Camacho Quijano, Marco René
Keywords: BIOMEDICINA
TRYPANOSOMA SPP
MARCADORES MOLECULARES ITS
CATL
18SRRNA
ECUADOR
Issue Date: Apr-2022
Publisher: Universidad Internacional SEK
Citation: CT-BIO C140t/2022
Abstract: Diseases caused by Trypanosoma spp are one of the causes of death in tropical countries, these parasites being transmitted mainly by blood-sucking insects. The Trypanosoma genus has become a zoonotic agent that affects domestic and wild animals, as well as humans tangentially. Ecuador is a country that is located in a region with the presence of tropical and zoonotic diseases, there is not enough data to show a more complete picture of these diseases. The lack of a "Gold Standard" for the identification of different trypanosomes has been a problem for obtaining data, which is why different molecular markers have been developed that are directed towards different regions of the genome of these parasites. Among these markers are the transcribed spacer (ITS), cathepsin L-like protein (CatL) and the small subunit 18SrRNA and together create a phylogenetic matrix for the identification of Trypanosoma spp. The MEGA 11 program was used for the alignment of the obtained sequences, a phylogenetic tree was constructed from each marker with the Maximum Parsimony method. As a result, several parsimonious trees were obtained from each of the molecular markers, the one with the highest relationship and with a high bootstrap was chosen, thus being able to validate the matrix created for the phylogenetic differentiation of each trypanosome
Description: Las enfermedades causadas por Trypanosoma spp son una de las causas de muerte en los países tropicales, siendo estos parásitos transmitidos principalmente por insectos chupadores de sangre. El género Trypanosoma se ha con-vertido en un agente zoonótico que afecta a animales domésticos y silvestre, así como a humanos tangencialmente. Ecua-dor es un país que se encuentra ubicado en una región con presencia de enfermedades tropicales y zoonóticas, no existen suficientes datos que muestre un panorama más completo de estas enfermedades. La falta de un “Gold Estándar” para una identificación de diferentes tripanosomas, ha sido un problema para la obtención de datos, por eso se han desarro-llado diferentes marcadores moleculares que son dirigidos hacia diferentes regiones del genoma de estos parásitos. Entre estos marcadores se encuentran el espaciador trasncrito (ITS), proteína tipo catepsina L (CatL) y la subunidad pequeña 18SrRNA y en conjunto crear una matriz filogenética para la identificación de Trypanosoma spp. Se uso el programa MEGA 11 para el alineamiento de las secuencias obtenidas, se construyó de cada marcador un árbol filogenético con el método de Parsimonia Máxima. Como resultado se obtuvo de cada uno de los marcadores moleculares varios árboles parsimoniosos, se escogió el que más relación presentaba y con un alto de boostrap, de esta manera pudiendo validar la matriz creada para la diferenciación filogenética de cada tripanosoma.
URI: http://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/4750
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