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Title: Matriz de diagnóstico molecular y filogenia molecular de ALPHAVIRUS, con énfasis en virus MAYARO
Authors: Navarro, Juan Carlos
Arévalo Guerrero, Grace Elizabeth
Keywords: ALPHAVIRUS
ARBOVIRUS
FILOGENIA
MAYARO
Issue Date: 6-Oct-2021
Publisher: Universidad Internacional SEK
Citation: CT- CBIO A683m/2021
Abstract: El género Alphavirus pertenece la familia de virus Togaviridae, son transmitidos por artrópodos (Arbovirus) y que se clasifican serológicamente en 11 complejos, su distribución geográfica abarca todos los continentes excepto la Antártica. Son virus pequeños y esféricos, poseen envoltura y su genoma es una hebra simple de RNA de sentido positivo de aproximadamente 11 a 12 Kb que codifican proteínas estructurales y no-estructurales. Las proteínas estructurales E1 y E2 son la diana de numerosas reacciones serológicas y por lo tanto útiles en pruebas inmunológicas de laboratorio, E1 contiene más epítopos conservados y de reacción cruzada. Los Alphavirus tienen ciclos de transmisión enzoonótica en primates no humanos, aves y roedores. Las anomalías climáticas, la deforestación y el creciente contacto de los seres humanos con los reservorios/vectores animales y la rápida evolución del vector favorecen su expansión y las enfermedades causadas por estos Arbovirus; de ahí que se justifica tener un programa eficaz de control por parte de la salud pública especialmente en los países de América del Sur. Los Alphavirus producen fiebre, pero aquellos que se encuentran en el Viejo Mundo causan artralgia, erupción en la piel y artritis mientras que los del Nuevo Mundo causan principalmente encefalitis, con excepciones como el Mayaro virus (MAYV) y eel virus UNA (UNAV). El MAYV fue detectado por primera vez en cinco pacientes febriles en el condado de Mayaro, Trinidad en 1954 y el principal vector es el mosquito Haemagogus spp. Los estudios filogenéticos de las secuencias del MAYV demuestran que puede delimitarse en tres genotipos, denominados D (“widely Dispersed”), L (“Limited”) y N (“New”). Una investigación de seroprevalencia de MAYV en la Amazonía, ecuatoriana mostró mayor presencia de anticuerpos en las personas nativas del área, así mismo, fue mayor en aquellos que se dedican a la caza y también en los de edad mayor a 30, lo cual se asocia con la exposición a ciclos endémicos y enzoóticos de este virus. El árbol filogenético de Alphavirus muestra a Salmon Pancreas Disease Virus (SPDV) y Sleeping Disease Virus (SDV) como ancestrales, lo cual podría implicar un origen de los Alphavirus en el Océano Pacífico. Los virus del clado de Semliki Complex han sido aislados en el Viejo Mundo, sin embargo, MAYV y UNAV son los únicos que a pesar de pertenecer a dicho clado han sido aislados en el Nuevo mundo. Según algunos autores MAYV fue introducido en América hace aproximadamente 2.000 a 3.000 años producto de la divergencia entre los complejos Semliki y WEEV posiblemente debido a las aves migratorias y los humanos. Esta investigación describe las relaciones filogenéticas de los Alphavirus, algunos de los cuales producen patologías de importancia veterinaria y humana, y se hace énfasis en MAYV que ha producido brotes epidémicos en Centro y Sudamérica. Se incluyen alphavirus específicos de insectos en la plataforma o matriz de identificación que anteriormente no estaban incluidos en un análisis general. Es necesario tener una plataforma de identificación molecular para Alphavirus y para Mayaro en caso de realizarse un diagnóstico molecular, esto nos permitiría realizar una identificación rápida de cualquier Alphavirus, incluyendo nuevas introducciones sin tener que recurrir a entidades internacionales.
Description: The genus Alphavirus belongs to the family of Togaviridae viruses, transmitted by arthropods (Arbovirus), and are serologically classified in 11 complexes. Their geographical distribution covers all continents except Antarctica. They are small and spherical viruses that have an envelope, and their genome is a single strand of positive sense RNA of approximately 11 to 12 Kb encoding structural and non-structural proteins. The structural proteins E1 and E2 are the target of numerous serological reaction, therefore they are useful in immunological laboratory tests, E1 contains more conserved and cross-reactive epitopes. Alphaviruses have enzootic transmission cycles in non-human primates, birds and rodents. Climatic anomalies, deforestation, the increasing contact of humans with animal reservoirs/vectors and the rapid evolution of the vector favor their expansion and the diseases caused by these Arboviruses; hence, it is justified to have an effective control program by public health especially in South American countries. Alphaviruses produce fever, but those found in the Old World cause arthralgia, skin rash and arthritis while those in the New World cause mainly encephalitis, with exceptions such as Mayaro virus (MAYV). MAYV was first detected in five febrile patients in Mayaro County, Trinidad in 1954, and the main vector is the mosquito Haemagogus spp. Phylogenetic studies of MAYV sequences show that it can be delimited into three genotypes, termed D ("widely Dispersed"), L ("Limited") and N ("New"). An investigation of the seroprevalence of MAYV in the Ecuadorian Amazon showed a higher presence of antibodies in the native people of the area, as well as in those who are engaged in hunting, also in those over 30 years of age, which is associated with the exposure to endemic and enzootic cycles of this virus. The Alphavirus phylogenetic tree shows Salmon Pancreas Disease Virus (SPDV) and Sleeping Disease Virus (SDV) as ancestral, which could imply an origin of Alphaviruses in the Pacific Ocean. The viruses of the Semliki Complex clade have been isolated in the Old World, however, MAYV and UNAV are the only ones that despite belonging to this clade have been isolated in the New World. According to some authors, MAYV was introduced in America approximately 2,000 to 3,000 years ago as a result of the divergence between the Semliki and WEEV complexes, possibly due to migratory birds and humans. This research describes the phylogenetic relationships of Alphaviruses, some of which produce pathologies of veterinary and human importance, with emphasis on MAYV which has produced epidemic outbreaks in Central and South America. Insect-specific alphaviruses are included in the identification platform or matrix that were not previously included in a general analysis. It is necessary to have a molecular identification platform for Alphavirus and for Mayaro in case of molecular diagnosis, this would allow us to make a quick identification of any Alphavirus, including new introductions, without having to route to international entities
URI: https://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/4468
Appears in Collections:Maestría en Biomedicina

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