Análisis de perfiles moleculares de resistencia antimicrobiana en aislados bacterianos de la familia Enterobacteriaceae obtenidos durante el año 2021 en el Hospital General Docente de Calderón, Quito-Ecuador

Abstract

Un grupo de bacterias de importancia clínica son los bacilos gramnegativos (BGN) de la familia Enterobacteriaceae, los cuales han dado lugar a varias infecciones en el ser humano Los aislados del género Klebsiella y Enterobacter constituyen enterobacterias que generalmente están relacionadas con infecciones adquiridas en la comunidad y en el ámbito hospitalario. La propagación de la resistencia por la enzima KPC constituye el mecanismo de resistencia más común en el Ecuador cuya naturaleza multirresistente puede causar graves problemas de salud. El gen bla KPC que codifica resistencia a carbapenémicos y otros betalactámicos puede estar asociado a otros determinantes que causan resistencia a otros tipos de antibióticos. Objetivo: Analizar los perfiles moleculares de resistencia antimicrobiana en aislados bacterianos de la familia Enterobacteriaceae obtenidos durante el año 2021 en el Hospital General Docente de Calderón mediante la plataforma de secuenciación de tercera generación Oxford Nanopore, para detectar los genes asociados con la resistencia fenotípica en esta casa de salud. Materiales y métodos: Para este estudio se utilizaron 20 aislados bacterianos pertenecientes a la colección de microorganismos del hospital, las cuales previamente fueron caracterizadas fenotípicamente como productoras de enzimas KPC. Dentro de la metodología utilizada, se efectuó la extracción de ADN bacteriano, se preparó la librería genómica con el kit Rapid Barcoding RBK-004, y posteriormente se realizó el análisis de las secuencias en el secuenciador MinION. Para el análisis de los resultados se utilizó la Plataforma EpI2ME. Resultados obtenidos: Las variantes del gen bla KPC: bla KPC-2, bla KPC-3, bla KPC-6 y bla KPC-14 confirieron resistencia enzimática a Betalactámicos; mientras que los alelos identificados como qnrB y oqxA codificaron la resistencia a las fluoroquinolonas.