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Título : Virus Hemorrágico Epizoótico (EHDV): filogeografía, complejo viral, linajes emergentes y trazas moleculares de introducción
Autor : Navarro Castro, Juan Carlos
Angulo Valladares, Leticia Mishell
Palabras clave : BIOMEDICINA
ENFERMEDADES HEMORRÁGICA EPIZOÓTICA
SEROTIPOS
ORBIVIRUS
CULICOIDES
Fecha de publicación : mar-2025
Editorial : Universidad Internacional SEK
Citación : CT-MBIOM A594v 2025
Resumen : La enfermedad hemorrágica epizoótica (EHD) es una patología viral de rumiantes silvestres y domésticos con importantes implicaciones sociales y económicas, causada por un arbovirus (EHDV), género Orbivirus, de ARN-doble cadena, transmitido por mosquitos Culicoides (Diptera: Ceratopogonidae), en cinco continentes. Es un virus emergente en el mediterráneo y, recién emergente en España, Italia y Francia (2022). En Ecuador, la EHD es definida como una enfermedad de notificación o declaración obligatoria. Sin embargo, no se la determina como una enfermedad de control oficial en el Ecuador, ya que existe poca evidencia serológica que demuestre su presencia en las zonas pecuarias del país. El objetivo principal fue inferir las relaciones evolutivas de genotipos virales de EHDV-genVP2, in silico, para determinar patrones taxonómicos relacionados con la correlación genotipo-fenotipo (serotipos), y filogeográficos de epidemiología molecular relacionados con su origen y trazas de movilidad e introducción. Se llevó a cabo un análisis filogeográfico utilizando 71 secuencias de ADN del gen VP2 de la cápside, con una longitud de 910 pb, provenientes de 19 países en cinco continentes. El análisis incluyó cuatro Orbivirus de referencia como grupos hermano y externo. Las construcciones filogenéticas se realizaron con Paup4.05build169, aplicando optimizaciones de Máxima Parsimonia y Máxima Verosimilitud, con bootstrap de 1.000 pseudoréplicas para la significancia y apoyo estadístico de clados. Los árboles resultantes de ambos métodos presentaron la misma topología. Se construyeron adicionalmente redes de haplotipos utilizando PopArt-TCS (parsimonia). Los resultados nos permitieron de mostrar la monofilia de los virus EHDV y un complejo viral relacionados con los grupos hermanos y dentro del clado EHDV. Se identificaron dos linajes virales principales, A y B. Los subclados mostraron una correlación genotipo-fenotipo con los serotipos conocidos. Adicionalmente se identificaron dos subclados monofiléticos (A4 de Japón y A1 de China), correlacionados con dos nuevos serotipos. También se determinó que todos los subclados incluyen secuencias de Australia, en su mayoría con posición basal sugiriendo un posible origen del EHDV en esta región y su evolución in situ y posible dispersión posterior. Se demostró también una relación evolutiva compartida para la secuencia de Ecuador con aquellas de Estados Unidos, y secuencias de España, Italia y Francia de reciente brote (2022) con secuencias de Túnez, sugiriendo una relación de intercambio comercial. Las redes de haplotipos comprueban estas trazas moleculares de intercambio o introducción con hasta con un solo cambio mutacional. Los resultados y conclusiones demuestran la importancia de la vigilancia genómica para la identificación, determinación de origen geográficos, nuevos linajes y serotipos de enfermedades virales emergentes, y su aplicación en estrategias de vigilancia, contención y control en salud global.
Descripción : Epizootic hemorrhagic disease (EHD) is a viral pathology affecting wild and domestic ruminants with significant social and economic implications, caused by an arbovirus (EHDV), genus Orbivirus, consisting of double-stranded RNA, transmitted by Culicoides mosquitoes (Diptera: Ceratopogonidae) across five continents. It is an emerging virus in the Mediterranean, recently identified in Spain, Italy, and France (2022). In Ecuador, EHD is defined as a notifiable or mandatory declaration disease. However, it is not classified as an official control disease in Ecuador due to limited serological evidence demonstrating its presence in the country's livestock areas. The main objective was to infer the evolutionary relationships of EHDV-genVP2 viral genotypes, in silico, to determine taxonomic patterns related to genotype-phenotype (serotypes) correlation and molecular epidemiological phylogeography related to its origin and traces of mobility and introduction. A phylogeographic analysis was conducted using 71 DNA sequences from the VP2 gene of the capsid, with a length of 910 bp, from 19 countries across five continents. The analysis included four reference Orbivirus as sister groups and outgroups. Phylogenetic constructions were made using Paup4.05build169, applying Maximum Parsimony and Maximum Likelihood optimizations, with bootstrap values of 1,000 pseudo replicates for significance and statistical support of clades. The resulting trees from both methods exhibited the same topology. Additionally, haplotype networks were constructed using PopArt-TCS (parsimony). The results allowed us to demonstrate the monophyly of EHDV viruses and a viral complex related to the sister groups within the EHDV clade. Two main viral lineages, A and B, were identified. The subclades showed a genotype-phenotype correlation with known serotypes. Furthermore, two monophyletic subclades (A4 from Japan and A1 from China) were identified, correlated with two new serotypes. It was also determined that all subclades include sequences from Australia, mostly in a basal position, suggesting a possible origin of EHDV in this region and it’s in situ evolution and potential subsequent dispersion. An evolutionary relationship was also shown for the Ecuadorian sequence with those from the United States and sequences from Spain, Italy, and France from the recent outbreak (2022) with sequences from Tunisia, suggesting a trade exchange relationship. Haplotype networks confirm these molecular traces of exchange or introduction, even with a single mutational change. The results and conclusions demonstrate the importance of genomic surveillance for identifying, determining geographic origins, new lineages, and serotypes of emerging viral diseases, and their application in global health surveillance, containment, and control strategies.
URI : https://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/5535
Aparece en las colecciones: Maestría en Biomedicina

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