Identificación de genes de resistencia y factores de virulencia en Listeria spp. de origen alimen-tario, a partir de datos producidos por NGS.

Abstract

Listeria monocytogenes es un patógeno alimentario causante de Listeriosis, provoca una mayor mortalidad en grupos vulnerables como ancianos, personas embarazadas o inmunodeprimidas. Aparece de forma no invasiva cuando causa una gastroen-teritis aguda, pero si aparece de forma invasiva provoca meningitis afectando al sistema nervioso o listeriosis materno-fetal, causando un aborto espontáneo. Los diferentes grados de patogenicidad ocurren por la presencia de factores de virulencia en locaciones cro-mosómicas como: LIPI-1 o LIPI3. El objetivo de esta investigación es caracterizar genes de resistencia y factores de virulencia del Género Listeria spp. a partir de datos producidos por Secuenciación de Genoma Completo (WGS) mediante herramientas bioinfor-máticas para la comprensión de riesgos enfocados a la contaminación alimentaria y su transmisión. Métodos: las lecturas crudas se obtuvieron en la plataforma NCBI en la sección SRA, mediante la plataforma Galaxy Australia se realizó un ensamblaje genómico con: SPAdes, Quast, FASTQc, Trimmomatic; para la detección del resistoma bacteriano se utilizó ABRIcate y para la genotipifica-ción se utilizó MLST. Resultados: Se identificó a 2 muestras de L. innocua y 66 muestras de L. monocytogenes, donde el Linaje I está relacionado con infecciones humanas como listeriosis y un Linaje II con la contaminación en entornos alimentarios. El linaje I presentó clones hipervirulentos como CC1, CC6 y CC217 por la presencia de Listeriolisina S (LLS), CC2 y CC87 presentaban genes de LIPI-1 e internalinas. El linaje II tuvo al CC121 que presentaba genes de resistencia como lsa(E) y lnu(B), el CC19 presentó el gen tet(M). Conclusión: se identificó la expresión de ciertos factores hipervirulentos en clones específicos por lo cual esto permite conocer los diferentes grados de virulencia que puede tener una misma especie bacteriana, siendo esto relevante para la vigilancia epidemiológica para identificar cepas de alto riesgo y la mejora de la seguridad alimentaria.