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http://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/4460| Title: | Perfil genómico del TCGA pan-cáncer de los genes involucrados en el ritmo circadiano |
| Authors: | López-Cortés, Andrés Navarro, Juan Carlos Pèrez Villa, Andy Ismael |
| Keywords: | PAN-CÁNCER RITMO CIRCADIANO ALTERACIONES GENÓMICAS TCGA BIOINFORMÁTICA HALLMARKS DEL CÁNCER |
| Issue Date: | 25-Jul-2021 |
| Publisher: | Universidad Internacional SEK |
| Citation: | CT- CBIO P438p/2021 |
| Abstract: | El ritmo circadiano controla varios procesos fisiológicos, metabólicos y de conducta en respuesta a cambios periodo ambientales en un ciclo de 24h. La disrupción del ritmo circadiano esta asociada con un mayor riesgo, desarrollo y progresión del cáncer. Los ritmos circadianos están controlados por complejas redes autoreguladoras de transcripción-traducción que al verse alteradas por cambios genéticos pueden conllevar a la tumorogénesis. Aunque varios elementos del reloj circadiano han sido estudiados, existen aun limitados análisis integrativos de las alteraciones de los genes del ritmo circadiano. Por esta razón, en este análisis multiómico integrado se estudio las alteraciones genómicas de 206 genes involucrados en el ritmo circadiano en 32 tipos de TCGA Pan-Cáncer. Se encontró un total de 140,939 alteraciones genómicas, siendo mRNA low el tipo de alteración más frecuente. El estadio tumoral con mayor frecuencia de alteraciones fue T2. Consecuentemente, 50 genes estuvieron altamente alterados y las vías de señalización más significativas que abarcan fueron el ritmo y reloj circadianos. Finalmente, este set de genes esta involucrado en el establecimiento de los diferentes hallmarks del cáncer. En conclusión, este análisis bioinformático mostro el perfil genómico de las alteraciones de los genes del ritmo circadiano, mostrando genes involucrados en la tumorogénesis y que podrían ser investigados para posibles terapias contra el cáncer. |
| Description: | The circadian rhythm governs several physiological, metabolic and behavioral functions adapted to 24h day-night periodicity. The disruption of circadian rhythms is associated with cancer risk, development and progression. Circadian rhythms operate through complex autoregulatory networks of transcription-translation, when disturbed by genetic changes, it undergoes tumorigenesis. Although elements of the circadian clock machinery have been studied, there is few integrated multi-omics analyses about the genetic alterations of the circadian rhythm. Therefore, this multi-omic analysis studied the genomic alterations of 206 genes involved in the circadian rhythm among 32 TCGA-PanCacer types. A total of 140,939 genomic alterations were found, being mRNA low the most frequent. T2 was the tumor stage with the highest genomic alteration frequency. Consequently, 50 genes were highly altered, and the most significant signaling pathways were circadian rhythm and circadian clock. Finally, this set of genes stablishes different hallmarks of cancer. Overall, this bioinformatic analysis showed the genomic profiles of the alterations among the circadian rhythm related genes, showing genes involved in tumorigenesis and that could be further studies for possible therapies to treat cancer. |
| URI: | https://repositorio.uisek.edu.ec/handle/123456789/4460 |
| Appears in Collections: | Maestría en Biomedicina |
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